MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 60963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_017857	TGG	2	6	284924	284929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126170
5503	NC_017857	GAAG	2	8	284976	284983	50 %	0 %	50 %	0 %	387126170
5504	NC_017857	GCC	2	6	285160	285165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126170
5505	NC_017857	GCTT	2	8	285170	285177	0 %	50 %	25 %	25 %	387126170
5506	NC_017857	ACA	2	6	285314	285319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126170
5507	NC_017857	GAA	2	6	285402	285407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126170
5508	NC_017857	GAT	2	6	285423	285428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126170
5509	NC_017857	CTT	2	6	285442	285447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126170
5510	NC_017857	GGT	2	6	285471	285476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126170
5511	NC_017857	CGG	2	6	285487	285492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126170
5512	NC_017857	GCG	2	6	285517	285522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126170
5513	NC_017857	GTC	2	6	285523	285528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126170
5514	NC_017857	ATACT	2	10	285542	285551	40 %	40 %	0 %	20 %	387126170
5515	NC_017857	GAA	2	6	285633	285638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126170
5516	NC_017857	TGC	2	6	285671	285676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126170
5517	NC_017857	AAT	2	6	285708	285713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126170
5518	NC_017857	GAT	2	6	285717	285722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126170
5519	NC_017857	GAA	2	6	285726	285731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126170
5520	NC_017857	TAC	2	6	285759	285764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126170
5521	NC_017857	TAC	2	6	285773	285778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126170
5522	NC_017857	GTAC	2	8	285825	285832	25 %	25 %	25 %	25 %	387126170
5523	NC_017857	GGC	2	6	285852	285857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126170
5524	NC_017857	TGG	2	6	286004	286009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126170
5525	NC_017857	AGA	2	6	286022	286027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126170
5526	NC_017857	TGAT	2	8	286120	286127	25 %	50 %	25 %	0 %	387126170
5527	NC_017857	GCG	2	6	286150	286155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126170
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5529	NC_017857	ATTT	2	8	286227	286234	25 %	75 %	0 %	0 %	387126170
5530	NC_017857	CTG	2	6	286261	286266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126170
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5533	NC_017857	ACA	2	6	286388	286393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126170
5534	NC_017857	TGA	2	6	286412	286417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126170
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5536	NC_017857	TAC	2	6	286608	286613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126170
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5538	NC_017857	TAAA	2	8	286689	286696	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5540	NC_017857	T	8	8	286770	286777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_017857	TCT	2	6	286925	286930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_017857	TGT	2	6	286938	286943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_017857	T	6	6	286965	286970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_017857	AAC	2	6	286986	286991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_017857	TTG	2	6	287121	287126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_017857	T	6	6	287160	287165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_017857	TCT	2	6	287172	287177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_017857	TGG	2	6	287254	287259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126171
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5551	NC_017857	A	7	7	287365	287371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_017857	A	7	7	287402	287408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_017857	CGT	2	6	287414	287419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_017857	GCTTCA	2	12	287467	287478	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387126172
5555	NC_017857	T	6	6	287487	287492	0 %	100 %	0 %	0 %	387126172
5556	NC_017857	TTG	2	6	287546	287551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126172
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5566	NC_017857	GTAT	2	8	287973	287980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5569	NC_017857	GGTT	2	8	288140	288147	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_017857	AGA	2	6	288172	288177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_017857	AGAAC	2	10	288308	288317	60 %	0 %	20 %	20 %	387126173
5572	NC_017857	TAATA	2	10	288321	288330	60 %	40 %	0 %	0 %	387126173
5573	NC_017857	TCCA	2	8	288384	288391	25 %	25 %	0 %	50 %	387126173
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5587	NC_017857	TCCA	2	8	288915	288922	25 %	25 %	0 %	50 %	387126173
5588	NC_017857	A	6	6	289003	289008	100 %	0 %	0 %	0 %	387126173
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5591	NC_017857	TGC	2	6	289151	289156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126173
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5594	NC_017857	GC	3	6	289255	289260	0 %	0 %	50 %	50 %	387126173
5595	NC_017857	T	8	8	289443	289450	0 %	100 %	0 %	0 %	387126174
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5598	NC_017857	ATTA	2	8	289485	289492	50 %	50 %	0 %	0 %	387126174
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5607	NC_017857	GCT	2	6	290213	290218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126176
5608	NC_017857	CAGTG	2	10	290234	290243	20 %	20 %	40 %	20 %	387126176
5609	NC_017857	GCG	2	6	290254	290259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126176
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5612	NC_017857	ATT	3	9	290397	290405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126176
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5622	NC_017857	TA	3	6	290778	290783	50 %	50 %	0 %	0 %	387126177
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5993	NC_017857	TTG	2	6	310309	310314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126197
5994	NC_017857	GTC	2	6	310327	310332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126197
5995	NC_017857	CAT	2	6	310350	310355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126197
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5997	NC_017857	AAT	2	6	310481	310486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126197
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